Добрый день!
Поскольку у вас всего 3 хоста, то при вводе в режим обслуживания сервера данные эвакуировать вам банально некуда.
После реинстала ESXi сервера есть специальная инструкция, как его добавить обратно в vSAN кластер. Проверьте, подключился ли он к кластеру vSAN. Инструкция здесь VMware Knowledge Base
А ошбка "nable to apply DRS resource settings on host. this can significantly reduce the effectiveness of DRS" лечится перезапуском менеджмент агентов. Например через CLI - services.sh restart.